Из исходников он собирается каким-нибудь gfortran из комплекта mingw32 или mingw64 командой gfortran *.f вызванной в каталоге, где эти *.f файлы лежат.
Запускается из консольного режима (Пуск->Выполнить->cmd) командой packmol < input-file, где < называется перенаправление ввода-вывода, и оно читает текстовый файл и скармливает его программе, как ( Read more... )

Посмотрел вчера достаточно интересный вебинар по terachem: http://www.petachem.com/ как на видеокартах с Cuda можно считать квантовую химию в масштабах до тысяч атомов (и, соответственно, с переносом зарядов и с протеканием химических реакций в отличие от механических моделей). Захотел себе теслу и лицензию на эту софтину, я знаю что можно на этом

После долгого секса с библиотеками третьего питона всё-таки собрал GaussSum 3.0. Теперь оно умеет Raman Intensity само считать зная длину волны лазера и температуру в комнате. Плюс я выяснил, что месячный расчёт в новом firefly даёт весьма приличные результаты, и раздумываю насчёт апгрейда считающей машинки (и мне сильно интересно, будет ли ( Read more... )

Получены изображения слабых водородных связей с помощью АСМ:
http://phys.org/news/2013-10-image-weak-hydrogen-bond-afm.html

Квантовомеханическое моделирование различных вариантов солнечных батареек:
http://phys.org/news/2013-10-simulations-technology-solar-collector-quantum.htmlНе совсем новость, но внезапно всплыло в обсуждениях ABBYY Compreno ( Read more... )

Введение
Для описания процессов на молекулярном уровне в настоящее время обычно используют нерелятивистское уравнение Шредингера в стационарной форме:

( Read more... )

Точное измерение эмиссионных свойств квантовых точек в растворе методом спектроскопии корреляции фотонов (примерно как зетасайзер, но для излучающих частиц):
http://phys.org/news/2013-06-fine-tuning-emissions-quantum-dots.html

Светодиоды на основе струйной печати квантовых точек:
http://phys.org/news/2013-06-cheaper-greener-inkjet-printed-hybrid- ( Read more... )

В MIT создали одну из наиболее достоверных на данный момент молекулярную модель кости человека:
http://medicalxpress.com/news/2013-04-decipher-molecular-basis-bone-remarkable.html#ajTabs
Съёмка движения атомов в реальном времени:
http://phys.org/news/2013-04-image-atoms-real-video.htmlВообще сейчас активно развивается группа методов расчётной ( Read more... )

Кристофер Крамер, автор одного из наиболее вменяемых учебников по компьютерной химии, выкладывает в сеть свои лекции:
http://pollux.chem.umn.edu/8021/Lectures/

Тихо и незаметно вышел релиз-кандидат Firefly 8.0.0
http://classic.chem.msu.su/gran/firefly/firefly8_rc.html

И снова AMDшный A8 он умудряется перегреть до зависона, надо будет всё-таки потратиться на более мощный кулер, медный Zalman не справляется ( Read more... )

Продолжение, часть 1, часть 2

Обычно для публикации в статье, курсовой, дипломе, диссертации и т.д. результат предыдущего этапа не слишком хорош, но его можно доработать в ручном режиме. для этого нам понадобится:

• gnuplot, программа построения графиков, сайт http://gnuplot.info, инструкции по работе http://t16web.lanl.gov/Kawano/gnuplot/index-e. ( Read more... )